"Das Virus" oder "Die Krankheit des Universums", wie sie vom Alten Volk genannt wurde. JENOVA ist die Gefahr, die vor 2000 Jahren vom Himmel hinabstürzte und auf dem nördlichen Kontinent eine riesige Wunde in den Planeten riss. Durch ihre Vielzahl an Fähigkeiten, unter anderem der Gestaltwandlung gelang es ihr, die Cetra zu überlisten und sie einen nach dem anderen auszurotten. Einigen auserwählte Kriegern von ihnen aber, gelang es noch, JENOVA rechtzeitig einzuschliessen. Fast 2000 Jahre später begehen die ShinRa einen schrecklichen Fehler mit ihrem Plan, den ultimativen Krieger mit den Zellen der Cetra zu erschaffen. Denn als sie JENOVA immer noch in ihrer veränderten Gestalt finden und sie fälschlicherweise als eine des Alten Volkes identifizieren, bereiten sie die Geburt etwas viel Schlimmerem vor.

Rolle in Final Fantasy VII: JENOVA taucht das erste Mal in dem Container im 67. Stockwerk des ShinRa-HQ auf. Nachdem der Körper verschwindet, weil sich Sephiroth ihrer bemächtigt, gilt es nachdem er sein Körper-Replikat immer wieder aufgibt, den jeweiligen Teil JENOVA's zu bekämpfen. Auch in der Vergangenheit taucht sie in den nicht nur in ihrer durch ihre Fähigkeit der Gestaltwandlung cetraartigen Gestalt im Container des Nibel-Reaktors auf, sondern auch in Fehlaufzeichnungen Doktor Gast's auf, die seinen Aufnahmen im Icicle INN entstanden, welches Hojo an sich gerissen hatte. Während Sephiroth seine Klone bis zur Nordhöhle ruft, wo er mit JENOVA's Kopf weilt, findet die Wiedervereinigung JENOVA's durch die nach und nach toten Klone statt, so dass JENOVA in ihrer wahren Gestalt in einem letzten Kampf kurz vor Sephiroth vor den Helden erscheint.

Rolle in Final Fantasy VII Advent Children: JENOVA erscheint in Erzählungen und Flashback's des Films. Das Geostigma welches durch ihre sich im Lebensstrom befindenden Zellen verursacht wird, erinnert immer noch an ihre kränkende Anwesenheit. Auch durch die von ShinRa gefundenen JENOVA-Zellen die Tseng und Elena gleich zu Beginn des Filmes suchen, sowie Sephiroth, welcher durch die Zellen zurückkehrt, ist JENOVA noch in irgendeiner Art und Weise anwesend, auch wenn sie keinen Einfluss ausüben kann, abgesehen von dem Wiedervereinigungs-Drang, den Sephiroth und damit auch seine Abkömmlinge von JENOVA geerbt haben.